本期专栏咱们将聚焦乳腺癌协商,讨论纳米孔测序在周全评价乳腺癌危急基因渐变,以及拓宽咱们对乳腺癌中具备精确疗养潜力渐变的了解等方位的前沿运用案例。
基于CAS9的纳米孔靶向测序周全探测乳腺癌热门渐变、布局变异和甲基化特色
图例
基于CAS9的PCR-free纳米孔靶向富集文库制备过程
即使针对乳腺癌分子记号物的测序探测办法日趋丰硕,但在本质运用中仍有痛点和难点,譬喻没法同步探测碱基粉饰,短读长对布局变异探测的束缚,高模范投入量,漫长的测验过程等。来自美国约翰霍普金斯大学的协商人员开采了一种基于CAS9的标的地域富集法子,贯串纳米孔测序,周全评价模范中的SNV,热门地域的布局变异,以及探测启动基因启动子的甲基化程度。经过在乳腺癌细胞系及成对肿瘤-一般布局模范的考证剖析,协商人员可在单张MinION芯片上赢得X的标的地域测序深度—足以探测标的渐变。该计划为精巧、快捷、周全评价癌症标的渐变供给了新的思绪。
发布文件:
TargetednanoporesequencingwithCas9-guidedadapterligation
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